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基本信息

項(xiàng)目名稱:
血清中肝癌相關(guān)microRNA的穩(wěn)定性分析
小類:
生命科學(xué)
簡介:
本課題通過研究MicroRNA的穩(wěn)定性,運(yùn)用qRT-PCR方法分析比較正常人和肝癌患者相關(guān)microRNA的表達(dá)量,從而進(jìn)一步研究其是否可作為潛在的檢測肝癌的生物標(biāo)記物。該方法深入到基因?qū)用?,具有特異性好,靈敏度高的優(yōu)點(diǎn)。此外本課題所研究的microRNA來自血清樣本,相比目前國內(nèi)外研究多著眼于組織樣本,具有清潔、無創(chuàng)傷性,且取樣方便、可連續(xù)檢測。
詳細(xì)介紹:
目前臨床上肝癌的檢測有影像學(xué)、蛋白標(biāo)志物、酶學(xué)標(biāo)志物,標(biāo)志物檢測的敏感性和特異性是決定其臨床價(jià)值的兩個(gè)重要因素,目前檢測肝癌的傳統(tǒng)方法為蛋白檢測技術(shù)和影像學(xué)技術(shù),因存在局限性,確診多在晚期,導(dǎo)致治愈率低,死亡率高。本課題通過研究MicroRNA的穩(wěn)定性,運(yùn)用qRT-PCR方法分析比較正常人和肝癌患者相關(guān)microRNA的表達(dá)量,從而進(jìn)一步研究其是否可作為潛在的檢測肝癌的生物標(biāo)記物。該方法深入到基因?qū)用?,具有特異性好,靈敏度高的優(yōu)點(diǎn)。此外本課題所研究的microRNA來自血清樣本,相比目前國內(nèi)外研究多著眼于組織樣本,具有清潔、無創(chuàng)傷性,且取樣方便、可連續(xù)檢測。利用高通量實(shí)施熒光定量PCR技術(shù)系統(tǒng)篩選肝臟疾病患者血清中microRNA的表達(dá)變化,鑒定若干具有臨床意義的肝臟疾病診斷及早期檢測血清標(biāo)志物。本項(xiàng)目的實(shí)施在基礎(chǔ)研究和臨床應(yīng)用兩方面均具有重要的意義,不僅將提升我國在相關(guān)研究領(lǐng)域的水平,還將可能為臨床常見的肝損傷、肝炎和肝癌等重大疾病的診斷和治療提供新的、更加靈敏的檢測指標(biāo)。

作品圖片

  • 血清中肝癌相關(guān)microRNA的穩(wěn)定性分析
  • 血清中肝癌相關(guān)microRNA的穩(wěn)定性分析
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  • 血清中肝癌相關(guān)microRNA的穩(wěn)定性分析
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作品專業(yè)信息

撰寫目的和基本思路

本研究通過對(duì)不同形態(tài)的肝癌相關(guān)樣本,包括肝癌Huh-7細(xì)胞系、臨床肝癌組織和血液樣本中的miRNA在不同條件下穩(wěn)定性的評(píng)價(jià)。本研究使用18S rRNA作為對(duì)照基因,7種由相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道的肝癌相關(guān)miRNAs為目的基因。在a)不同溫度下(-80℃,-20℃,4℃,室溫)放置3 h;b)在室溫下放置0、1、3、6、12和24 h等6種條件下處理后的樣本經(jīng)過40個(gè)循環(huán)的定量反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)進(jìn)行測定。

科學(xué)性、先進(jìn)性及獨(dú)特之處

臨床上肝癌的檢測有影像學(xué)、蛋白標(biāo)志物、酶學(xué)標(biāo)志物,因存在局限性,確診多在晚期,導(dǎo)致治愈率低,死亡率高。本課題通過研究MicroRNA的穩(wěn)定性,運(yùn)用qRT-PCR方法分析比較正常人和肝癌患者相關(guān)microRNA的表達(dá)量,進(jìn)一步研究其是否可作為潛在檢測肝癌的生物標(biāo)記物。該方法具有特異性好,靈敏度高的優(yōu)點(diǎn)。所研究的microRNA來自血清樣本,清潔、無創(chuàng)傷性,且取樣方便、可連續(xù)檢測。

應(yīng)用價(jià)值和現(xiàn)實(shí)意義

血清作為生物檢測樣本,具有取材方便,無創(chuàng)傷性,并可連續(xù)體外檢測的優(yōu)點(diǎn),而且血清miRNA的高度穩(wěn)定性也使得病人的實(shí)際值與實(shí)驗(yàn)的測試值相當(dāng)?shù)奈呛希虼搜錷iRNA水平可作為癌癥或其它疾病的生物標(biāo)記物,為癌癥及其它疾病的診斷提供一種新的敏感、特異、簡單、非損傷性的臨床診斷技術(shù),用于腫瘤分類、預(yù)后及療效預(yù)測、手術(shù)療效監(jiān)測及疾病復(fù)發(fā)預(yù)測等領(lǐng)域,并可能帶來未來臨床醫(yī)學(xué)上的變革。

學(xué)術(shù)論文摘要

MicroRNA (miRNA) 是一類長度約22 nt的非編碼單鏈RNA,具有基因表達(dá)調(diào)控的功能。血清中miRNA可作為檢測各類癌癥與疾病的潛在生物標(biāo)記物,用于病人外周血癌癥的早期檢測與癌癥復(fù)發(fā)的檢測。因此,有必要系統(tǒng)研究癌癥相關(guān)血清中miRNA的穩(wěn)定性。 本研究的目的在于對(duì)不同形態(tài)的肝癌相關(guān)樣本,包括肝癌Huh-7細(xì)胞系、臨床肝癌組織和血液樣本中的miRNA在不同條件下穩(wěn)定性的評(píng)價(jià)。本研究使用18S rRNA作為對(duì)照基因,7種由相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道的肝癌相關(guān)miRNAs為目的基因在6種不同條件下進(jìn)行處理。處理后的樣本經(jīng)過40個(gè)循環(huán)的定量反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)進(jìn)行測定。結(jié)果顯示,在不同條件下肝癌相關(guān)miRNAs都有擴(kuò)增,并且miRNA在極端苛刻的條件下能抵抗降解,保持穩(wěn)定。而核糖體RNA(rRNA)較為脆弱,其相對(duì)擴(kuò)增量在非生理測試中急劇下降,較易降解。 綜上所述,肝癌相關(guān)miRNAs在血清中穩(wěn)定存在且能被檢測到;在同一物種不同個(gè)體的血清中重復(fù)性好;其表達(dá)量與性別不相關(guān);能特異性區(qū)分肝癌血清與正常血清,可作為肝癌的潛在生物標(biāo)記物。 關(guān)鍵詞:miRNA;癌癥;穩(wěn)定性;血清;生物標(biāo)記物

獲獎(jiǎng)情況

1 項(xiàng)目相關(guān)研究論文 金幼芳,徐根明,李艷,孟麗, 姜永厚,郭江峰,丁先鋒* (2011) 定量PCR檢測microRNA表達(dá)的數(shù)據(jù)歸一化新技術(shù). 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展 2 項(xiàng)目相關(guān)發(fā)明專利申請(qǐng) microRNA生物標(biāo)志物及其用途,申請(qǐng)?zhí)枺?01010220241.9 1; 申請(qǐng)人:浙江理工大學(xué);發(fā)明人: 丁先鋒,郭江峰,李艷, 徐立堅(jiān),姚虎,呂佳嵐, 朱恒怡 3 承擔(dān)科研項(xiàng)目情況 項(xiàng)目名稱:卵巢癌血清miRNA的篩選及在早期診斷中的應(yīng)用意義 經(jīng)費(fèi)來源:浙江省科技創(chuàng)新活動(dòng)計(jì)劃(新苗人才計(jì)劃),1萬元 起止日期:2010.01-2011.03

鑒定結(jié)果

該課題具新穎性、創(chuàng)新性,完成較好,結(jié)果較好。所獲成果屬實(shí)。

參考文獻(xiàn)

1.Jiang Y, Shang H, Xu H, Ding X,Zhao L,Fang L,Chen W.Detection and genotyping of porcine circovirus in naturally infected pigs by oligo-microarray. Res Vet Sci.2010, 89(1):133-9. 2.金幼芳,徐根明,李艷,孟麗,姜永厚,郭江峰,丁先鋒.定量PCR檢測microRNA表達(dá)的數(shù)據(jù)歸一化新技術(shù). 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展,2011. 3.李艷,苗杰,丁先鋒,許利堅(jiān),姚虎. Stability Analysis of Liver Cancer Related MicroRNAs. Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 2010, 43(1) :69-78. 4.李艷,丁先鋒,苗杰.非編碼RNA檢測技術(shù)的研究進(jìn)展. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué).2010,38(11):5546-5548 5.Wang F,Zheng Z,Guo J and Ding X. Correlation and quantitation of microRNA aberrant expression in tissues and sera from patients with breast tumor. Gynecologic Oncology,2010,119(3):586-593. 6.丁佳女,張羽,丁先鋒,郭江峰. RNA在離體小鼠肝臟組織中的穩(wěn)定性.中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2010,26(4): 581-585. 7.Fornari, F., L. Gramantieri, M. Ferracin, A. Veronese, S. Sabbioni, G.A. Calin, G.L. Grazi, C. Giovannini, C.M. Croce, L. Bolondi, M. Negrini. MiR-221 controls CDKN1C/p57 and CDKN1B/p27 expression in human hepatocellular carcinoma [J]. Oncogene, 2008, 27(43):5651-5661.

同類課題研究水平概述

目前,傳統(tǒng)的檢測肝癌方法主要是蛋白檢測技術(shù)和影像學(xué)技術(shù),但由于其局限性導(dǎo)致肝癌確診多在晚期,治愈率低?;蛟\斷具有靈敏度高,特異性好的優(yōu)點(diǎn)。目前研究多研究組織樣本中的microRNA,本課題創(chuàng)新性的對(duì)血清樣本中的MicroRNA進(jìn)行研究。通過文獻(xiàn)查詢及已有的實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ),推測microRNA具有成為檢測肝癌的潛在生物標(biāo)記物,而其能穩(wěn)定存在是基本前提。因此有必要系統(tǒng)研究其穩(wěn)定性。本課題主要利用qRT-PCR方法,對(duì)3個(gè)不同樣本7條microRNA在6種不同條件處理下,進(jìn)行穩(wěn)定性分析。 目前國內(nèi)外的相關(guān)文獻(xiàn)主要涉及:文獻(xiàn)1:肝癌異常表達(dá)microRNAs的鑒定、功能、作用靶點(diǎn)以及治療潛力研究,何星星,華中科技大學(xué)。其研究microRNAs的表達(dá)量變化;文獻(xiàn)2:肺癌95D與95C細(xì)胞株中轉(zhuǎn)移相關(guān)miRNAs的篩選研究,周美玉,中南大學(xué)。其基于Trizol提取方法對(duì)血漿miRNA分離過程進(jìn)行優(yōu)化;文獻(xiàn)3:大鼠肝癌細(xì)胞與胚胎肝細(xì)胞microRNA差異表達(dá)譜的研究,吳印濤,第四軍醫(yī)大學(xué)。使用miRNA芯片對(duì)不同轉(zhuǎn)移能力肺癌細(xì)胞株進(jìn)行篩選以找到與肺癌轉(zhuǎn)移相關(guān)的microRNAs;專利4:從人血清/血漿樣本中分離RNA方法及其PCR驗(yàn)證法,丁先鋒,201010220261.6。.用TaqMan qRT-PCR確認(rèn)肝癌中異常表達(dá)的microRNAs并利用肝癌裸鼠移植瘤模型其治療潛力;專利5:microRNA生物標(biāo)記物及其用途,丁先鋒,李艷。microRNA生物標(biāo)記物用于制備具有肝癌檢測能力的試劑盒;論文6:血漿microRNA提取技術(shù)優(yōu)化,趙德堯,浙江理工大學(xué)學(xué)報(bào)。利用Trizol試劑從人血清/血漿樣本中分離RNA以有效獲得高質(zhì)量且含量高的RNA方法; 本課題比較了肝癌相關(guān)7種microRNAs在肝癌血清與健康血清中的表達(dá)量。發(fā)現(xiàn)該7種miRNAs能特異區(qū)分肝癌血清與正常血清,可用作肝癌的潛在生物標(biāo)志物。同時(shí)建立了一種高效的血清RNA分離方法——預(yù)加熱法,該方法可將樣本CT 值降低至少5個(gè)循環(huán),有利于miRNA表達(dá)譜的研究和異常miRNA表達(dá)疾病預(yù)后的研究。 綜上所述,本課題“血清中肝癌相關(guān)microRNA的穩(wěn)定性分析”具有很好的新穎性。 本課題科技查新報(bào)告,請(qǐng)見附頁。
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