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基本信息

項(xiàng)目名稱:
豬GDF11 基因cDNA的克隆及組織表達(dá)分析
小類:
生命科學(xué)
簡(jiǎn)介:
GDF11基因在中軸骨發(fā)育過程中起重要調(diào)控作用。本研究目的在于克隆了豬的GDF11基因cDNA序列并測(cè)序;然后采用熒光定量PCR的實(shí)驗(yàn)方法檢測(cè)該基因在豬的14種組織中的表達(dá)差異;最后對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行生物信息學(xué)分析
詳細(xì)介紹:
本研究旨在克隆豬GDF11基因部分cDNA,并檢測(cè)其在不同組織中的表達(dá)差異。結(jié)果表明,所克隆的豬GDF11基因序列為1161bp(GeneBank: HQ657211.2),該序列與GeneBank公布的預(yù)測(cè)的豬GDF11基因僅有3 bp的差異。該基因編碼332個(gè)氨基酸,氨基酸序列與人、小鼠、大鼠、牛、馬、兔子、斑馬魚的GDF11氨基酸序列同源性分別為99.10%、99.10%、99.10%、99.40%、99.10%、98.80%、78.82%。熒光定量PCR分析結(jié)果顯示,GDF11在14種組織中均有表達(dá),在脊髓中表達(dá)水平最高,其次為背膘,在胃中的表達(dá)水平最低,各組織之間表達(dá)水平差異不顯著(P>0.05)。該研究為進(jìn)一步研究豬GDF11基因的功能奠定了基礎(chǔ)。

作品專業(yè)信息

撰寫目的和基本思路

GDF11基因在中軸骨發(fā)育過程中起重要調(diào)控作用。本研究目的在于克隆了豬的GDF11基因cDNA序列并測(cè)序;然后采用熒光定量PCR的實(shí)驗(yàn)方法檢測(cè)該基因在豬的14種組織中的表達(dá)差異;最后對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行生物信息學(xué)分析。

科學(xué)性、先進(jìn)性及獨(dú)特之處

結(jié)果顯示,GDF11在14種組織中均有表達(dá),在脊髓中表達(dá)水平最高,其次為背膘,在胃中的表達(dá)水平最低,各組織之間表達(dá)水平差異不顯著(P>0.05)。以前對(duì)GDF11基因的研究主要集中在胚胎發(fā)育階段,而本研究的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物為成體豬。

應(yīng)用價(jià)值和現(xiàn)實(shí)意義

鑒于GDF11基因在中軸骨發(fā)育中的重要調(diào)控作用、GDF11-/-小鼠胸腰椎數(shù)增加和基因組進(jìn)化上的保守性,推測(cè)在豬的身上GDF11基因極有可能具有相同的調(diào)控作用。豬的胸腰椎數(shù)存在變異,本研究所用實(shí)驗(yàn)動(dòng)物里岔黑豬的胸腰椎數(shù)多為22枚,屬于多腰椎的品種。

學(xué)術(shù)論文摘要

生長(zhǎng)分化因子11(Growth and differentiation factor-11,簡(jiǎn)稱GDF11)是BMP/TGF-β超家族一員,編碼一種在早期胚胎發(fā)育過程中起重要作用的骨形態(tài)發(fā)生蛋白,在確立骨骼模式中起重要作用。本研究旨在克隆豬GDF11基因部分cDNA,并檢測(cè)其在不同組織中的表達(dá)差異。結(jié)果表明,所克隆的豬GDF11基因序列為1161bp(GeneBank: HQ657211.2),該序列與GeneBank公布的預(yù)測(cè)的豬GDF11基因僅有3 bp的差異。該基因編碼332個(gè)氨基酸,氨基酸序列與人、小鼠、大鼠、牛、馬、兔子、斑馬魚的GDF11氨基酸序列同源性分別為99.10%、99.10%、99.10%、99.40%、99.10%、98.80%、78.82%。熒光定量PCR分析結(jié)果顯示,GDF11在14種組織中均有表達(dá),在脊髓中表達(dá)水平最高,其次為背膘,在胃中的表達(dá)水平最低,各組織之間表達(dá)水平差異不顯著(P>0.05)。該研究為進(jìn)一步研究豬GDF11基因的功能奠定了基礎(chǔ)。

獲獎(jiǎng)情況

鑒定結(jié)果

參考文獻(xiàn)

[1] Andersson O, Reissmann E, Ibá?ez CF. Growth differentiation factor 11 signals through the transforming growth factor-β receptor ALK5 to regionalize the anterior–posterior axis. EMBO Rep. 2006, 7(8): 831-837. [2] McPherron AC, Lawler AM, Lee SJ. Regulation of anterior/posterior patterning of the axial skeleton by growth/differentiationfactor 11. Nat Genet. 1999, 22: 260-264. [3] Nakashima, M, Toyono, T, Akamine, A, and Joyner, A. Expression of growth/differentiation factor 11, a new member of the BMP/TGFβ superfamily during mouse embryogenesis. Mech Dev. 1999, 80(2): 185-189.

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