基本信息
- 項目名稱：
- 水產品中諾如病毒的檢測及其系統(tǒng)發(fā)育分析
- 小類：
- 生命科學
- 大類：
- 自然科學類學術論文
- 簡介：
- 本論文研究水產品中諾如病毒的高效病毒濃縮、提取方法，建立諾如病毒RT-PCR檢測方法，對水產品樣品和腹瀉病人糞便樣品進行檢測，對陽性病毒蛋白進行三級結構預測并建立同源模型。通過借助BLASTX比對、進化樹構建等生物信息學方法，對檢出的陽性病毒進行型別鑒定與系統(tǒng)發(fā)育分析，蛋白質三級結構預測，3D同源建模為進一步探索水產品中諾如病毒流行規(guī)律和流行因素，制訂諾如病毒引起的食源性疾病防控對策提供技術依據(jù)。
- 詳細介紹：
- 本論文研究水產品中諾如病毒的高效病毒濃縮、提取方法，建立諾如病毒RT-PCR檢測方法，對水產品樣品和腹瀉病人糞便樣品進行檢測，對陽性病毒蛋白進行三級結構預測并建立同源模型。通過借助BLASTX比對、進化樹構建等生物信息學方法，對檢出的陽性病毒進行型別鑒定與系統(tǒng)發(fā)育分析，蛋白質三級結構預測，3D同源建模為進一步探索水產品中諾如病毒流行規(guī)律和流行因素，制訂諾如病毒引起的食源性疾病防控對策提供技術依據(jù)。
作品專業(yè)信息
撰寫目的和基本思路
- 本研究以水產品中污染的諾如病毒為研究對象，研究諾如病毒靈敏、快速的分子檢測和高效的病毒濃縮方法，并對實際樣本中諾如病毒的污染狀況進行調查，為進行流行病學調查研究和大規(guī)模突發(fā)性疾病暴發(fā)時病因的溯源打下基礎。
科學性、先進性及獨特之處
- 國內外針對腹瀉性病人糞便樣品諾如病毒的檢測已有較深入的研究報道，但以水產品等傳播載體進行探究的相關文獻報道相對較少。本研究主要針對水產品預處理（病毒濃縮）、諾如病毒快速檢測方法建立及其分子流行病學等開展研究與探索，首次對廈門及周邊地區(qū)的水產品中諾如病毒污染情況進行了調查，并對檢測出陽性病毒菌株核酸進行蛋白質三級結構預測及3D同源建模。
應用價值和現(xiàn)實意義
- 諾如病毒是引起食源性病毒性腹瀉性疾病的重要病因之一。貝類等水生生物由于其濾過性攝食的特性，被認為是諾如等食源性病毒傳播的高危載體。目前，尚無詳盡的相關病毒學標準用于諾如病毒的檢測。因此，建立便捷、可靠的諾如病毒檢測方法，就廈門及周邊地區(qū)的水產品進行病毒污染情況調查，具有較好實際應用價值和現(xiàn)實意義。
學術論文摘要
- 本論文研究水產品中諾如病毒的高效病毒濃縮、提取方法，建立諾如病毒RT-PCR檢測方法，對水產品樣品和腹瀉病人糞便樣品進行檢測，對陽性病毒蛋白進行三級結構預測并建立同源模型。通過借助BLASTX比對、進化樹構建等生物信息學方法，對檢出的陽性病毒進行型別鑒定與系統(tǒng)發(fā)育分析，蛋白質三級結構預測，3D同源建模為進一步探索水產品中諾如病毒流行規(guī)律和流行因素，制訂諾如病毒引起的食源性疾病防控對策提供技術依據(jù)。
獲獎情況
- 獲第五屆“挑戰(zhàn)杯”集美大學學生課外學術科技作品競賽自然科學類三等獎
鑒定結果
- 無
參考文獻
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同類課題研究水平概述
- 近年來世界范圍內相繼報道多起食物因污染Nov病毒導致急性胃腸炎的暴發(fā)和散發(fā)，引起了各國政府和科學工作者的重視。目前，諾如病毒的診斷方法主要有直接電鏡法、免疫電鏡法(IEM)、放射免疫法(RIA)、酶免疫分析法(EIA)、RT-PCR等。由于諾如病毒目前無法進行細胞培養(yǎng)，而且在水產品中諾如病毒含量一般較低，檢測有一定難度。近30年來隨著檢測手段的發(fā)展和調查研究的深入，檢測技術有較大的突破，例如，Herrmann等建立了用甘氨酸緩沖液從海產品組織中直接洗提病毒的方法;張穎等人應用RT-PCR方法檢測貝類中諾如樣病毒的研究；Green李暉等將巢式RT-PCR方法應用到貝類樣品諾如病毒檢測中, 其靈敏度比單輪RT-PCR方法提高了10-1000倍；Myrmel等利用熒光定量RT-PCR和熒光定量nested RT-PCR對挪威海岸水產品中腸道病毒進行了檢測分析，貝類樣品諾如病毒檢出率為6. 8%, 冬季更高；潘良文等建立了從貝類中提取諾如病毒的RNA并進行實時熒光RT-PCR檢測方法；蘇來金等初步建立了貝類中諾如病毒SYBR Green I實時定量RT-PCR檢測方法，比常規(guī)RT-PCR方法敏感100倍，并對所檢測到的貝類中陽性株核酸片段進行克隆、轉化、序列分析和同源比對，顯示5份諾如病毒陽性株均為GGII型，與國內報道的GII型毒株同源性達到98%以上；汪俊等對太平洋牡蠣中諾如病毒檢出的2株陽性樣品進行了序列分析，表明貝類中諾如病毒與腸胃炎病人糞便中諾如病毒的高同源性。諾如病毒在自然界中的宿主、
