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基本信息

項目名稱:
PCR-SSP法檢測29種HLA-B27亞型
小類:
生命科學
簡介:
本次檢測強制性脊柱炎(AS)方法是在新的高分辨PCR-SSP法基礎上建立起來的。與以往檢測相比,此法充分考慮所設計引物的特異性,實驗結果表明,此法能夠檢測出以往方法不能達到的29條基因亞型。該法根據內對照及有無特異性區(qū)帶使判定結果一目了然,可以快速準確的對HLA-B27的相關亞型進行檢測,從亞型水平探究AS的發(fā)病機制,提供了臨床上早期診斷AS的新方法。
詳細介紹:
本次檢測強制性脊柱炎(AS)方法是在新的高分辨PCR-SSP法基礎上建立起來的。與以往只能檢測7~23條亞型的不足而造成的缺乏性和完整性不足相比,此法充分考慮所設計引物的特異性,并對多數已有的PCR檢測條件做出相應調整,實驗結果表明,此法能夠檢測出以往方法不能達到的29條基因亞型。該法根據內對照及有無特異性區(qū)帶使判定結果一目了然,可以快速準確的對HLA-B27的相關亞型進行檢測,從亞型水平探究AS的發(fā)病機制,提供了臨床上早期診斷AS的新方法,為進一步研究HLA-B27與疾病的關聯(lián),深入探討AS的發(fā)病機制奠定了基礎。同時與傳統(tǒng)醫(yī)學檢測手段相比,本檢測手段可以較全面檢測盡可能多分子亞型,對器材要求低,速度快,在基因水平診斷上,具有良好的預見性,非常適于臨床應用。

作品圖片

  • PCR-SSP法檢測29種HLA-B27亞型
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作品專業(yè)信息

撰寫目的和基本思路

目的:建立一種新的聚合酶鏈反應-序列特異性引物(PCR-SSP)高分辨技術檢測HLA-B27基因亞型,為HLA-B27基因多態(tài)性研究奠定實驗學基礎。 基本思路: 設計合成HLA-B27亞型特異性引物35條(配對組成上下游引物組合29對)和內對照引物一對,建立PCR-SSP方法,用于B27亞型分型。檢測標本HLA-B27陽性研究對象外周血基因組DNA。

科學性、先進性及獨特之處

科學性:由于HLA-B27基因在不同人群分布有明顯的差異且不同的抗原也存在差別,從分子水平研究HLA-B27亞型與AS的相關性更準確。 先進性:該法具有高度特異性、敏感性、實驗操作簡便快速、對樣本要求低和無需昂貴設備等特點,內對照的引入更保證了檢測結果的可靠性。 獨特性:高分辨HLA-B27亞型檢測可分析多達29種亞型;根據內對照及有無特異性區(qū)帶使判定結果一目了然、快速準確。

應用價值和現(xiàn)實意義

PCR-SSP法從基因的多態(tài)性出發(fā),可以檢測HLA-B27的32種亞基中的29種,范圍更廣,滿足當前醫(yī)學檢測需要。與血清法、流式細胞術等相比具有準確性高、靈敏度強、耗材少、用時少、成本低等優(yōu)越性,更適用于醫(yī)學類尤其是醫(yī)院檢測。且在臨床上對于AS的早期診斷和治療具有重要意義,適于患者早期確診,區(qū)分類風濕類疾病與AS患者,避免誤診。本實驗進一步證明AS與HLA-B27的相關性,具有醫(yī)學意義。

學術論文摘要

目的 建立一種新的聚合酶鏈反應-序列特異性引物(PCR-SSP)高分辨技術檢測29種HLA-B27基因亞型。方法 設計合成HLA-B27亞型特異性引物35條(配對組成上下游引物組合29對)和內對照引物一對,建立PCR-SSP方法,用于B27亞型分型。檢測標本為117例HLA-B27陽性研究對象(男79名,女38名)外周血基因組DNA 。 結果 117例標本的PCR-SSP擴增均獲得成功,成功的構建了PCR-SSP檢測反應體系。共檢測出6種亞型:B*2702、B*2703、B*2704、B*2705、B*2706及B*2713。六種亞型的構成比分別為:0.85%、6.84%、64.10%、25.64%、1.71%、0.85%,其中B*2704和B*2705為中國漢族人群中主要亞型。 結論 應用該新型PCR-SSP高分辨技術進行HLA-B27基因亞型檢測能檢測出較多HLA-B27亞型,且該法進行B27亞型分型分辨度高、特異性強,成本較低,適合于臨床應用。

獲獎情況

于《分子診斷與治療雜志》(ISSN 1674-6929;CN 44-1656/R)2011年5月第3期刊發(fā)

鑒定結果

117例標本擴增均獲得成功,構建了PCR-SSP檢測反應體系。 共檢測出6種亞型:B*2702、B*2703、B*2704、B*2705、B*2706及B*2713。

參考文獻

[1]Schlosstein L, Terasaki PI, Bluestones R, et al. High association of an HL-A antigen, B27, with ankylosing spondylitis. N Engi J Med, 1973, 288:704-706. [2]Brewerton DA, Caffrey M, Hart FD, et al. Ankylosing spondylitis and HLA-B27. Lancet, 1973, 1 (7809): 904-907. [3]Taurog JD. The Mystery of HLA–B27: If It Isn’t One Thing, It’s Another. Arthritis Rheum, 2007, 56: 2478-2481. [4] Dowing J, Coates E, Street J, et al. A High-Resolution Polymerase Chain Reaction-Sequence-Specific Primer HLA-B*27 Typing Set and Its Application in Routine HLA-B27 Testing. Genet Test, 2006, 10:98–103. [5]Downing J, Guttridge MG, Thompson J, et al. Five-locus HLA typing of haematopoietic stem cell donor volunteers by PCR using sequence specific primers. Genet Test , 2004, 8:301–312. [6] 李一榮,胡麗華,陳鳳花,等. 應用SYBR GreenⅠ實時熒光PCR法對中國漢族人群HLA-B27進行快速基因分型. 臨床血液學雜志,2008,21(5):526-529. [7] 馮忠軍,賀端明. HLA-B27的檢測及其臨床應用. 河北醫(yī),2008.1,30(1):90-92. [8] 張相文,蘭炯采,鄭世榮. HLA-B27PCR基因分型及血清學結果比較. 中國輸血雜志,1997,10:671.

同類課題研究水平概述

目前檢測HLA-B27基因亞型手段中,常用的有經典的血清學分型技術、流式細胞術及磁珠酶聯(lián)免疫檢驗法和基因分型技術,不常用的有玫瑰花法、ELISA法等。 1,微量淋巴細胞毒法 HLA- B27抗原與其特異性抗體結合.優(yōu)點: 操作簡便,準確率尚可且,成本較低;缺點:單價血清獲取困難,受細胞純度、補體差異、操作繁瑣,單抗效價及HLA高度多態(tài)性的影響,易出現(xiàn)錯判漏判. 2, 流式細胞技術 流式細胞技術結合單克隆抗體,可以迅速區(qū)分出淋巴細胞亞群,并檢測出CD+3細胞中HLA-B27抗原陽性的細胞百分比.優(yōu)點: 可以迅速區(qū)分出淋巴細胞亞群,結果精確;缺點:HLA-B27單克隆抗體和儀器只有較大醫(yī)院才擁有。 3, 磁珠酶聯(lián)免疫檢驗法 結合磁珠分離和酶聯(lián)免疫分析,分離全血中HLA-B27抗原及白細胞及染色。優(yōu)點:特異性強,敏感度高,重復性好。缺點:操作步驟復雜。 4, HLA基因分型技術 目前檢測HLA-B27亞型的基因分型技術主要有聚合酶鏈反應-序列特異性引物(PCR-SSP),DNA 限制性片段長度多態(tài)性分析, PCR-單鏈構象多態(tài)性及PCR-DNA測序等方法。最為常用的為PCR-SSP,其優(yōu)點為: 準確性高、靈敏度強、耗材少、用時少、成本低等優(yōu)越性,更加適用于醫(yī)學類尤其是醫(yī)院檢測. 缺點:易受感染出現(xiàn)假陰性和標本的DNA交叉污染. 文獻資料顯示,絕大多數實驗室采用檢測HLA-B27方法為微量淋巴細胞毒試驗檢測法. HLA基因分型技術較血清學分型有以下優(yōu)點:(1)只需全血0.5 ml即可獲得足夠數量的DNA,并可重復數十次試驗;(2)可保存于無水乙醇中,視其純度存放多年;(3)由于加入了429 bpHGH內對照引物,使實驗方法更加可靠,避免出現(xiàn)漏檢和假陽性反應;(4)實驗快捷簡便,特異性強、靈敏度高、穩(wěn)定性好。微量的DNA就可以擴增達到106~107倍的量,達到常規(guī)方法檢測所需的濃度. 由于受HLA基因分型技術的限制,以往的研究中往往只能分析少量HLA-B27亞型,從亞型水平探討AS的發(fā)病機制的研究結果缺乏精確性與完整性。因此創(chuàng)建的一種新的PCR-SSP高分辨技術,以檢測到更多種HLA-B27基因亞型,為進一步研究HLA-B27基因亞型與AS的關系打下實驗室基礎,這是國內外許多學者研究的熱點之一。
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