基本信息
- 項目名稱：
- 數(shù)字候選基因法及其在挖掘豬新候選基因中的應(yīng)用
- 小類：
- 生命科學
- 大類：
- 自然科學類學術(shù)論文
- 簡介：
- 候選基因法是畜禽經(jīng)濟性狀基因的主要挖掘手段之一，但傳統(tǒng)候選基因法的應(yīng)用受到了信息瓶頸的嚴重制約。如何打破信息瓶頸，對傳統(tǒng)候選基因法進行新的發(fā)展具有重要的科學意義。 網(wǎng)絡(luò)資源的快速積累促進了數(shù)字化分析技術(shù)的發(fā)展，網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫中海量的數(shù)據(jù)為打破傳統(tǒng)候選基因法面臨的信息瓶頸提供了契機。本項目將通過深入挖掘網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)，發(fā)展新的數(shù)字候選基因法，并在豬的經(jīng)濟性狀基因挖掘進行嘗試性應(yīng)用。
- 詳細介紹：
- 1 豬經(jīng)濟性狀相關(guān)基因研究進展及加大新基因挖掘力度的必要性 建立在微效基因（多基因）模型基礎(chǔ)上的傳統(tǒng)數(shù)量遺傳學對家養(yǎng)農(nóng)業(yè)動物的遺傳改良作出了巨大貢獻，但長期以來缺乏剖解、分析單個數(shù)量性狀基因的方法和手段，分子數(shù)量遺傳學的出現(xiàn)則改變了這種局面。近年來，運用分子數(shù)量遺傳學的研究方法挖掘家豬經(jīng)濟性狀主基因或連鎖標記一直是畜牧科學的研究熱點。目前，在豬的連鎖圖譜上已積累了近萬個標記，其中包括了數(shù)千個功能基因 ( )。豬基因作圖結(jié)果的快速積累為其經(jīng)濟性狀相關(guān)基因的篩選奠定了良好的基礎(chǔ)。 到目前為止，通過候選基因法（candidate gene approach）或基因組掃描法(genome-wide scan)，已鑒定出一些與繁殖、生長、胴體和肌肉品質(zhì)性狀相關(guān)的基因（含QTL）或與之連鎖的分子標記。氟烷基因（Hal）中的氟烷敏感等位基因（Haln）已被證明能促進肌肉生長，抑制脂肪沉積并能導致PSE肉的發(fā)生（Smith and Bampton，1977；Fujii, et al, 1991；Leach, et al, 1996）。酸肉基因（RN基因）中RN－等位基因使得豬肉加工后失重多，引起酸肉狀態(tài)(Le Roy, et al,1990；Milan,et al,1996)。ESR、FSHβ亞基和PRLR等基因作為產(chǎn)仔數(shù)的候選基因已引起國內(nèi)外的廣泛關(guān)注(Rothschild et al, 1996；Short et al, 1997；趙要風等，1999；朱猛進等，2001；Kaminski et al, 2002；Isler et al, 2002；van Rens et al, 2002；徐迎寧等，2003)。生長激素（growth hormone, GH）基因和類胰島素生長因子（insulin-like growth factor，IGF）基因由于在生長軸中調(diào)控地位的重要性而曾被當作肌肉生長性狀的候選基因（Casas-Carrillo, et al，1997；Knorr, et al，1997；Cheng，et al，2000），其中IGF已被確定為狗體型控制主基因（Sutter, et al., 2007）。心臟脂肪酸結(jié)合蛋白基因（heart fatty acid binding protein，H-FABP）和脂肪組織脂肪酸結(jié)合蛋白基因（adipocyte fatty acid binding protein，A-FABP）作為肌內(nèi)脂肪含量（intramuscular fat content，IMF）的候選標記也引起了國內(nèi)外學者的注意（Gerbens, et al，1997；1998；1999；2000；Nechtelberger et al, 2001）。此外，te Pas等（1999）發(fā)現(xiàn)肌細胞生成素基因（myogenin，MYOG）和初生重、生長速度及瘦肉率相關(guān)。鈣蛋白酶抑制蛋白基因（calpastatin，CAST）和抑肌素基因（myostatin gene, MSTN）是肌肉生長的重要候選基因之一(Ernst,et al,1998)。與脂肪酸代謝有關(guān)酶類、結(jié)合蛋白基因是背膘厚和瘦肉率的重要候選基因，如激素敏感脂肪酶基因（hormone sensitive lipase, HSL）、肥胖基因（obese, OB）等。在基因組掃描法研究方面， De koning等（1999）利用127個微衛(wèi)星標記將背膘厚QTL定位在7號和2號染色體上，同時將肌內(nèi)脂肪QTL定位在2、4、6和7號染色體上。還有研究者將肌纖維數(shù)QTL定位在12號染色體上（Anderson，et al,1996）；將肌肉嫩度QTL定位在4、7和15號染色體上（Rothschild, et al，1995；Paszek，et al,1998）；將平均背膘厚和腹肥肉率QTL定位在4號染色體上（Anderson，et al，1994）。綜合來看，生長和背膘厚的QTL在1、2、3、4、6、7、8、13、14和15號染色體上均有發(fā)現(xiàn)，肉質(zhì)性狀的QTL在2、3、4、6、7、12和15號染色體有分布，而繁殖性狀的QTL則被定位到4、6、7和8號染色體上。 在這些研究中，多數(shù)基因（或連鎖標記）還無法得到肯定，QTL在染色體上的位置的重復性不高、穩(wěn)定性較差，連鎖距離過大，甚至還有相互矛盾的結(jié)果。除了氟烷基因（Hal）和酸肉基因（RN基因）這類近乎質(zhì)量性狀的主基因外，對于豬繁殖、肌肉生長、脂肪沉積這些典型數(shù)量性狀的研究尚未得到絕對認可的結(jié)果?？偠灾?，基因定位的結(jié)果積累很快，但能得以確認的結(jié)果卻很少（楊達，2003），目前鑒定和積累的基因或標記還遠達不到實際應(yīng)用的程度。對于豬的多數(shù)經(jīng)濟性狀而言，仍然需要大規(guī)模篩選控制基因或連鎖標記，深入挖掘新的候選基因仍然十分必要。 2 豬基因（組）轉(zhuǎn)錄譜及研究方法發(fā)展現(xiàn)狀及不足 對豬經(jīng)濟性狀分子遺傳基礎(chǔ)的研究有助于發(fā)現(xiàn)新的候選基因，因此國內(nèi)外學者在挖掘豬主要經(jīng)濟性狀候選基因的同時，對豬經(jīng)濟性狀分子遺傳基礎(chǔ)的研究亦十分重視。分析基因轉(zhuǎn)錄過程是目前獲得目標性狀分子遺傳基礎(chǔ)知識的主要手段，所以基因轉(zhuǎn)錄譜已成為當前學術(shù)界的研究熱點之一。 研究基因轉(zhuǎn)錄譜（transcriptome）的方法有兩類，一是基于生物信息學原理的數(shù)字化技術(shù)(in silico techniques)，即研究基因的數(shù)字化表達圖譜（Audic，et al,1998；Bortoluzzi, et al，2000；Moreno, et al，2001；Bakay, et al，2002），二是用于基因?qū)嶋H表達分析的分子生物學實驗方法，包括Northern雜交、逆轉(zhuǎn)錄-PCR（RT-PCR）、差異顯示PCR方法（differential display RT-PCR, DDRT-PCR）、消減雜交(subtractive hybridization, SH)、DNA芯片技術(shù)(DNA chip technique)、基因表達系列分析（serial analysis of gene expression, SAGE）、表達序列標簽串聯(lián)排列連接（tandem arrayed ligation of expressed sequence tags, TALEST）（Spinella et al，1999）和GeneCalling（Shimkets，2004）等，其中涉及豬的研究多集中于分子生物學方法。Wesolowski等（2004）用DDRT-PCR技術(shù)對母豬胎兒快速生長期（21、35和45天）內(nèi)胚胎的11個重要功能基因的轉(zhuǎn)錄譜變化進行了研究。Junghans等（2004）用DDRT-PCR和實時RT-PCR技術(shù)比較了在飼喂大豆蛋白日糧和酪蛋白日糧下生長豬肝臟四個基因的差異表達情況。Blomberg le和Zuelke（2004）以附植前胚胎作實驗材料，首先公開報道了SAGE技術(shù)用于豬的轉(zhuǎn)錄譜分析。Bai等（2003）用cDNA microarray技術(shù)測定了豬不同類型骨骼肌中低等和中等豐度表達基因的差異轉(zhuǎn)錄譜，鑒定出一批可能參與肌肉表型決定（phenotype determination）的候選基因。趙書紅等（2003）用cDNA 宏陣列技術(shù)對豬胚胎期和出生后骨骼肌基因表達差異進行了初步研究。潘佩文等（2002）用mRNA差異顯示技術(shù)分析了不同豬種肌肉發(fā)育過程中基因的表達差異，篩選出一批豬種特異表達和差異表達的ESTs。另外，該領(lǐng)域的不少研究主要著重于對研究技術(shù)的發(fā)展（Moody，et al，2002；Yao，et al，2002；Nobis，et al，2003； Bertani，et al，2003）。 從這些研究進展可以發(fā)現(xiàn)，目前有關(guān)豬基因轉(zhuǎn)錄譜的研究主要局限于分子生物學實驗方法。在這些分子生物學實驗方法中，差異顯示技術(shù)（DDRT-PCR）檢測基因數(shù)目有限，重復性較差，不適合大規(guī)模的基因表達研究。盡管少數(shù)實驗室開始在豬中運用cDNA陣列和SAGE這類基因高通量技術(shù)研究豬的基因轉(zhuǎn)錄譜，但對于那些旨在篩選豬經(jīng)濟性狀主基因或連鎖標記的普通研究室而言，很難承擔cDNA陣列和SAGE技術(shù)帶來的高昂實驗成本?？傊?，目前有關(guān)豬基因轉(zhuǎn)錄譜的研究并不系統(tǒng)，側(cè)重于分子生物學技術(shù)本身的研究較多，重點探討經(jīng)濟性狀分子遺傳基礎(chǔ)的研究較為欠缺，一些新的研究策略的運用相對不足，該領(lǐng)域的研究需要進一步加強和深入。 3 數(shù)字候選基因法的提出 候選基因法（candidate gene approach）和基因組掃描法(genome-wide scan) 是挖掘畜禽數(shù)量性狀主基因和關(guān)聯(lián)標記的兩種基本方法。其中，候選基因法具有不需要特殊試驗設(shè)計、統(tǒng)計檢驗效率較高、成本低廉、操作簡便、檢測方案易于實施、適用于除高度連鎖不平衡群體之外的任何群體以及可直接運用于分子育種實踐等優(yōu)點（徐迎寧，1999；張沅等，2001）。不過，傳統(tǒng)候選基因法的缺點也很明顯。一方面，確定候選基因的過程是一個含有較多主觀推測成分的過程，與之配套的下游統(tǒng)計分析方法亦不能直接判定所篩選的候選基因是目標性狀的主基因還是與QTLs不平衡連鎖的間接標記；另一方面，人們確定候選基因多基于激素調(diào)控、生化路徑等生理生化信息，這使得可用的候選信息十分有限，信息瓶頸已成為制約候選基因法進一步應(yīng)用的明顯障礙。因此，如何克服候選基因法的缺點是目前篩選經(jīng)濟性狀基因的研究中所面臨的重要問題。 對于一個具體的數(shù)量性狀而言，表型直接由基因的表達過程所決定，即表型變異直接對應(yīng)于基因表達過程的變異，因而性狀的表型變異最終是由直接控制和間接參與基因所引起的表達過程變化所決定（環(huán)境作用一般通過應(yīng)激相關(guān)基因及其下游級聯(lián)基因的表達途徑作用于性狀）。顯然，性狀本身的組織內(nèi)或上游信息源器官內(nèi)（如肌肉的上游信息源器官為肝臟和垂體）影響性狀發(fā)育過程表達變化的基因就是控制性狀表型變異的基因。因此，從性狀本身的基因表達調(diào)控過程著手，是突破信息瓶頸制約的有效途徑。不過，在基因表達過程的變異組分中，主要組分體現(xiàn)了內(nèi)外環(huán)境的影響，不能由上代傳給下代，是非遺傳性的，只有部分變異組分由遺傳所致。顯然，控制性狀變異的候選基因的相關(guān)信息已經(jīng)蘊含在基因表達信息中，通過對性狀發(fā)育過程基因表達規(guī)律的分析是獲取候選基因的有效途徑。但是，一般實驗室很難承受用高通量分子生物學方法測定性狀基因轉(zhuǎn)錄譜帶來的高昂試驗成本。隨著網(wǎng)絡(luò)資源的指數(shù)型增長，已出現(xiàn)多種儲存基因表達信息的網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫，分子生物學實驗不再是獲取基因表達信息的唯一途徑。由于數(shù)據(jù)庫的信息源是世界各地研究者通過實驗得到的真實數(shù)據(jù)及其衍生數(shù)據(jù)，因此，在信息量龐大的網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫支持下，通過檢索數(shù)據(jù)庫獲取的信息量遠比一次或少數(shù)幾次實際分子生物學實驗得到的信息多。顯然，通過網(wǎng)絡(luò)資源分析特定性狀發(fā)育的基因表達過程已初步具備成熟條件。不過，在如何利用網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫基因表達信息揭示性狀分子遺傳基礎(chǔ)，以及如何構(gòu)建并利用數(shù)字化的表達過程篩選經(jīng)濟性狀候選基因方面，尚未建立配套的系統(tǒng)理論和方法。數(shù)字候選基因法（digital candidate gene approach，DigiCGA）的核心功能是從性狀虛擬轉(zhuǎn)錄過程中提取可能的候選基因。不同于電腦克隆、CATS等比較結(jié)構(gòu)基因組學方法，它在信息源的利用上，遵守了比較功能基因組學原理，即綜合利用網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫中多個物種同類性狀的基因表達信息，構(gòu)建某一物種目標性狀的數(shù)字化轉(zhuǎn)錄過程，并通過轉(zhuǎn)錄過程的規(guī)律分析進而篩選出性狀可能的候選基因。 4. 本項目作品的研究內(nèi)容 傳統(tǒng)的候選基因法嚴重依賴于已有的先驗信息，存在耗費高、需時多、主觀臆斷等諸多不足。當前網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫迅速發(fā)展，各種基因組數(shù)據(jù)大量積累，發(fā)展一種新的生物信息學原理的數(shù)字化策略篩選候選基因，可以打破信息瓶頸，大大縮短篩選時間和減少耗費，達到經(jīng)濟、迅速篩選候選基因的目的。 本項目作品發(fā)展了候選基因法并提供了相應(yīng)軟件。數(shù)字候選基因法做為傳統(tǒng)候選基因法的發(fā)展，通過綜合利用網(wǎng)絡(luò)資源和多來源數(shù)據(jù)，克服了傳統(tǒng)候選基因法受信息瓶頸制約的不足。本作品提供的研究思想和軟件可在先驗知識不足的經(jīng)濟性狀候選基因篩選中得到較為廣泛的應(yīng)用，具有重要的實際應(yīng)用價值。 作品進一步挖掘了數(shù)字候選基因法的理論基礎(chǔ)，建立相關(guān)分析策略，并通過策略應(yīng)用，篩選候選基因并進行驗證，旨在建立一個數(shù)字候選基因法的理論可行策略和應(yīng)用模型，為對數(shù)字化篩選新候選基因研究提供參考依據(jù)和可行措施。
作品圖片
作品專業(yè)信息
撰寫目的和基本思路
- 【目的】建立數(shù)字候選基因法的分析策略和框架，對傳統(tǒng)候選基因法進行新的發(fā)展。 【基本思路】 一、利用生物信息手段構(gòu)建數(shù)字候選基因的篩選策略； 二、以目標性狀為例，選取網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫下載數(shù)據(jù)并進行整合分析，為數(shù)字化篩選提供標準數(shù)據(jù)集，通過數(shù)據(jù)聯(lián)合分析篩取目標性狀候選基因； 三、開發(fā)相應(yīng)分析工具對數(shù)據(jù)進行分析。
科學性、先進性及獨特之處
- 一、發(fā)展了一種新方法——數(shù)字候選基因法。提出豬數(shù)字候選基因分析策略，探索性嘗試把該方法引入到豬育種領(lǐng)域，為后續(xù)研究提供參考依據(jù)。 二、提出了“振蕩平衡假說”，并整合了網(wǎng)絡(luò)免疫基因數(shù)據(jù)，為數(shù)字候選基因法挖掘豬抗病性狀基因提供了數(shù)據(jù)源。 三、自主開發(fā)了分析軟件Filter，可主要完成針對豬健康性狀進行數(shù)據(jù)聯(lián)合分析的三種功能，支持Excel直接讀入和輸出，并可擴展應(yīng)用到豬其它性狀的相關(guān)分析中。
應(yīng)用價值和現(xiàn)實意義
- 實際應(yīng)用價值 發(fā)展了數(shù)字候選基因法并提供了相應(yīng)軟件，突出綜合利用網(wǎng)絡(luò)資源克服信息瓶頸，可在經(jīng)濟性狀候選基因篩選中實際應(yīng)用 現(xiàn)實意義 傳統(tǒng)的候選基因法存在信息瓶頸等不足。當前網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫迅速發(fā)展，發(fā)展新的生物信息學原理的數(shù)字化篩選策略，可達到經(jīng)濟、迅速篩選候選基因的目的。 項目探索了數(shù)字候選基因法的操作流程，并進行了實際應(yīng)用，為畜禽經(jīng)濟性狀基因的挖掘提供了新方法。
學術(shù)論文摘要
- 中文翻譯: 1 《數(shù)字候選基因法：一種鑒定候選基因的數(shù)字化方法》 摘要：到目前，候選基因法和基因組掃描法已被廣泛使用。然而由于信息瓶頸和其它缺點，該領(lǐng)域的研究并未取得預期進展。幾十年來網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)呈現(xiàn)指數(shù)性增長，為數(shù)字候選基因法的出現(xiàn)奠定了基礎(chǔ)。在這里，我們就數(shù)字候選基因法及我們提出的候選基因鑒定策略等相關(guān)內(nèi)容進行了總結(jié)。 2 《動物先天性免疫信號通路：超越還原主義》 摘要：免疫系統(tǒng)在保持生物內(nèi)環(huán)境的穩(wěn)定和平衡方面扮演著關(guān)鍵角色。動物先天性免疫一直是全球免疫學研究的焦點，目前已知其功能依賴于免疫信號通路網(wǎng)絡(luò)或級聯(lián)分子機器的行為。到目前，相關(guān)研究多集中在級聯(lián)分子組分與功能鑒定上，未對整體特征給予足夠重視，本質(zhì)上遵循了還原論研究模式。本文強調(diào)該研究領(lǐng)域從還原論到系統(tǒng)觀點的轉(zhuǎn)變，前半部分對動物先天性免疫信號通路主要方面進行了總結(jié)，著重強調(diào)免疫信號通路的整體特征，后半部分根據(jù)信號通路的整體特征提出了基于整體觀的振蕩平衡假說，主要用來刻畫動物先天性免疫系統(tǒng)信號轉(zhuǎn)導的整體特性，有助于從免疫網(wǎng)絡(luò)整合角度理解某些免疫學現(xiàn)象。 3 軟件論文已初步完成
獲獎情況
- 1 論文《Digital candidate gene approach (DigiCGA): A digitalized approach for candidate gene identification》已在中國畜牧獸醫(yī)學會信息技術(shù)分會2008年學術(shù)討論會論文集上發(fā)表，頁數(shù)180-185. 2 論文《Innate Immune Signaling Pathways in Animals: Beyond Reductionism》已被International Reviews of Immunology雜志正式接受（該雜志最新影響因子為4.935） 3 2009年榮獲湖北省第七屆“挑戰(zhàn)杯”大學生課外學術(shù)作品競賽 “特等獎”
鑒定結(jié)果
- 1 發(fā)表了2篇論文（含SCI論文） 2 自主開發(fā)了數(shù)字候選基因法的配套軟件 3 2009年榮獲湖北省第七屆“挑戰(zhàn)杯”大學生課外學術(shù)作品競賽 “特等獎”
參考文獻
- 1 M J Zhu and S H Zhao, Candidate Gene Identification Approach: Progress and Challenges. Int J Biol Sci 3(7):420-427, 2007. 2 N Tiffin, et al. Integration of text- and data-mining using ontologies successfully selects disease gene candidates. Nucleic Acids Res 33(5): 1544-1552, 2005. 3 M Ceresa, et al. A web-enabled database of human gene expression controlled annotations for gene list functional evaluation. Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc 2007:394-7, 2007. 4 R Medzhitov and C Jr Laneway, Advance in immology. New Engl J Med 343: 338-344, 2000. 5 Z Cao, et al, and D V Goeddel, TRAF6 is a signal transducer for Interleukin-1.Nature 383: 443-446, 1996. 6 H Kikuchi, J Itoh, and S Fukuda, Chronic nicotine stimulation modulates the immune response of mucosal T cells to Th1-dominant pattern via nAChR by upregulation of Th1-specific transcriptional factor. Neurosci Lett 432: 217-221, 2008.
同類課題研究水平概述
- 目前有關(guān)豬基因轉(zhuǎn)錄譜的研究主要局限于分子生物學實驗方法。在這些分子生物學實驗方法中，差異顯示技術(shù)檢測基因數(shù)目有限，重復性較差，不適合大規(guī)模的基因表達研究。盡管少數(shù)實驗室開始在豬中運用cDNA陣列和SAGE這類基因高通量技術(shù)研究豬的基因轉(zhuǎn)錄譜，但對于普通研究室而言，很難承擔高昂的實驗成本?？傊?，目前有關(guān)豬基因轉(zhuǎn)錄譜的研究并不系統(tǒng)，側(cè)重于分子生物學技術(shù)本身的研究較多，重點探討經(jīng)濟性狀分子遺傳基礎(chǔ)的研究較為欠缺，一些新的研究策略的運用相對不足，該領(lǐng)域的研究需要進一步加強和深入。 候選基因法和基因組掃描法是挖掘畜禽數(shù)量性狀主基因和關(guān)聯(lián)標記的兩種基本方法。其中，候選基因法具有不需要特殊試驗設(shè)計、統(tǒng)計檢驗效率較高、成本低廉、操作簡便、檢測方案易于實施、適用于除高度連鎖不平衡群體之外的任何群體以及可直接運用于分子育種實踐等優(yōu)點。不過，傳統(tǒng)候選基因法的缺點也很明顯。一方面，確定候選基因的過程是一個含有較多主觀推測成分的過程，與之配套的下游統(tǒng)計分析方法亦不能直接判定所篩選的候選基因是目標性狀的主基因還是與QTLs不平衡連鎖的間接標記；另一方面，人們確定候選基因多基于激素調(diào)控、生化路徑等生理生化信息，這使得可用的候選信息十分有限，信息瓶頸已成為制約候選基因法進一步應(yīng)用的明顯障礙。因此，如何克服候選基因法的缺點是目前篩選經(jīng)濟性狀基因的研究中所面臨的重要問題。 隨著網(wǎng)絡(luò)資源的指數(shù)型增長，已出現(xiàn)多種儲存基因表達信息的網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫，由于數(shù)據(jù)庫的信息源是世界各地研究者通過實驗得到的真實數(shù)據(jù)及其衍生數(shù)據(jù)，因此，在信息量龐大的網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫支持下，通過檢索數(shù)據(jù)庫獲取的信息量遠比一次或少數(shù)幾次實際分子生物學實驗得到的信息多。顯然，通過網(wǎng)絡(luò)資源分析特定性狀發(fā)育的基因表達過程已初步具備成熟條件。不過，在如何利用網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫基因表達信息揭示性狀分子遺傳基礎(chǔ)，以及如何構(gòu)建并利用數(shù)字化的表達過程篩選經(jīng)濟性狀候選基因方面，尚未建立配套的系統(tǒng)理論和方法。數(shù)字候選基因法的核心功能是從性狀虛擬轉(zhuǎn)錄過程中提取可能的候選基因。不同于電腦克隆、CATS等比較結(jié)構(gòu)基因組學方法，它在信息源的利用上，遵守了比較功能基因組學原理，即綜合利用網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫中多個物種同類性狀的基因表達信息，構(gòu)建某一物種目標性狀的數(shù)字化轉(zhuǎn)錄過程，并通過轉(zhuǎn)錄過程的規(guī)律分析進而篩選出性狀可能的候選基因。
